Tom Franklin est élevé dans la région rurale de Clarke County, au sud-ouest de l'Alabama, non loin du cadre où se dérouleront la plupart de ses romans. Il s'inscrit à l'Université de l'Alabama à Huntsville, puis à l'Université de l'Arkansas.
Sa carrière littéraire s'amorce avec la publication en 1999 de Poachers, un recueil de nouvelles. Son premier roman, paru en 2003, Hell at the Breech (La Culasse de l’enfer), fondé sur des faits historique, se déroule en 1890 quand Macy Burke, un adolescent blanc miséreux, tire accidentellement sur le riche commerçant Arch Bedsole. Tom Franklin obtient le Los Angeles Times Book Prize en 2010 et un Gold Dagger Award en 2011 pour Crooked Letter, Crooked Letter (Le Retour de Silas Jones) qui a pour cadre les milieux pauvres d'une petite ville du Mississippi
Il est le mari de la poétesse {{Lien}}.