Mlle Bille-en-tête et sa classe partent étudier les coraux et les poissons des mers du Sud au large de la Côte Ouest de l'Australie. Derrière les hublots du sous-marin, ils admirent les poissons-clowns, les poissons-chirurgiens, les poissons-perroquets, les crevettes, les crabes, etc. Mais de nombreux dangers les guettent : une anémone et ses tentacules venimeux, une murène géante, etc.